12月31日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线宣布了题为Crystal structure of human LDB1 in complex with SSBP2 的论文,该项作业由我国科学院生物物理研究所许文青/梁栋材课题组和美国国立卫生研究院Ann Dean课题组协作完结。
增强子是一种操控基因表达与否的开关,它们往往远离其操控的基因,坐落于编码框之外。因而,间隔基因很远的增强子和基因之间的DNA成环是基因转录激活十分要害的一步。在哺乳动物红细胞中,LDB1蛋白尽管本身不结合DNA,可是别离结合在远间隔增强子和红细胞生成相关基因上的LDB1转录复合物,可通过LDB1的二聚体化完结远间隔增强子和启动子之间的互作。LDB1-SSBP复合物是多种重要蛋白复合物如Wnt增强子复合物和LDB1转录复合物的中心复合物,对发育至关重要。SSBP蛋白阻挠LDB1蛋白在26S蛋白酶体中被降解,保持LDB1复合物的稳定性,从而促进转录复合物的安装,调控基因的表达。可是LDB1与SSBP怎么相互效果和LDB1怎么构成同源二聚体的分子机制尚未被提醒。
该论文初次报导了LDB1/SSBP2复合物的晶体结构。作者发现LDB1二聚体结构域(DD)包括一个N端核转运因子2(NTF2)姿态结构域和一个由α螺旋4和α螺旋5组成的子结构域,它们一起构成了LDB1二聚体效果面。LDB1二聚体的两个LDB/Chip保存结构域(LCCD)坐落中心DDs的旁边面,每个LCCD与SSBP2二聚体构成广泛的相互效果。LDB1 DD和LCCD之间的保存linker覆盖了LDB1 NTF2-like子结构域的潜在的配体结合口袋,这可能成为LDB1结构和功用的调控位点。此外,该文中的结构和生物化学数据为了解LDB1和LDB1/SSBP2相互效果怎么成为调控细胞挑选决议和长间隔增强子-启动子相互效果的不同复合物的结构中心,供给了结构根底。
该作业主要由生物物理所许文青/梁栋材课题组完结。许文青、闫小雪和Ann Dean是该论文的一起通讯作者,许文青/梁栋材课题组的博士研究生王红杨为该论文的榜首作者。这项作业得到生物大分子国家重点实验室、国家自然科学基金和中科院战略性先导科技专项的赞助和支撑。
LDB1/SSBP2复合物的三维结构
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