冯保被派去监视严府的动静，发现宫里竟然也派人查看严府的动静。严府大门紧闭，硬是任严世蕃砸破大门，严嵩也不见，在家中自顾晒书。严世蕃无奈在罗龙文、鄢懋卿的陪同下前往内阁值房找徐阶!但六部九卿的官员都被挡在西苑禁门之外。严世蕃如热锅上的蚂蚁，不知情势发生了什么变化，又见不到徐阶，只得愤愤离去。
因为兵部的急递，张居正必须面见徐阶。张居正接谭纶急报，海瑞、王用汲已审出郑泌昌、何茂才受严世蕃、杨金水指使毁堤淹田勾结倭寇。又接浙江抗倭的军情急报，不知二者有何关联。张居正深感倒严在此一举，不明白赵贞吉为何将海瑞审郑泌昌、何茂才供词作另案呈递，建议徐阶当务之急必须将海瑞审讯笔录郑泌昌、何茂才的供词呈奏嘉靖帝。
陈洪初掌司礼监大印，得意忘形开始排挤起吕芳手下的太监来。陈洪急于取吕芳而代之，以严嵩首辅之位来拉拢徐阶，徐阶不只是警觉，而且是一阵厌恶。
严嵩最后也把儿子严世蕃找来了。自己口述命儿子写信给胡宗宪，暗命胡宗宪倭寇不得不剿不能全剿，倭寇在胡宗宪就在，有胡宗宪在，严家就可不倒。
大明王朝1566第26集剧情介绍胡宗宪没有听严家的私见。明嘉靖四十年七月，处援军未到军需不继之困境，胡宗宪亲督戚家军发动了第八次台州抗倭大战，其“身冒炮矢，意在殉国，以全忠名”，赖戚家军将士奋勇血战，他没能殉国。该次台州大捷，促成了与为患十年之倭寇最后决战的态势!几次大战下来，几个徽商的订金都早已花完，浙江藩库已没有库银。赵贞吉急令抄了郑泌昌、何茂才的家。
有了这次大捷，十年倭患肃清在即!谭纶激动地建议赵贞吉立刻向朝廷报捷，给胡宗宪请功，给戚继光和所有将士请功，鼓舞士气。赵贞吉的后援之功也不能埋没，谭纶还要上疏替他请功。而赵贞吉却高兴不起来，原来除了一份兵部严令赵贞吉火速供给胡宗宪抗倭军需的急递之外，还有内阁司礼监送来的急递，都是责问钦案的，还有一封张居正的密信，暗称是奉了徐阶认可写给赵贞吉的。内阁司礼监将海瑞所审的供词打了回来重审，张居正却让赵贞吉在原供词上署名再报上去。
内阁和司礼监的廷寄用意是诱使二犯翻供，可赵贞吉做为主审官，接到这样的廷寄并不和陪审诸员商议，便当着郑泌昌、何茂才公然宣读，致使两名罪犯当堂翻供。赵贞吉责成海瑞以七天为期，两天审结，第三天八百里急递五日内必须送到京师!海瑞一连消失两天，眼看必须结审，赵贞吉打算亲自审问，骂海瑞貌似刚直，内藏沽名之心。不想海瑞突然出现，原来海瑞将郑泌昌、何茂才的走狗蒋千户、徐千户抓捕归案，在铁的证据面前二人交待了何茂才指使其毁堤淹田、私放倭寇井上十一郎诱陷百姓的事实。
大明王朝1566第27集剧情介绍嘉靖帝大张声势逮拿驻外的大宦官杨金水进京，圣意昭然，就是要让大家都知道，浙江的贪墨大案要挖根了。无论牵涉到谁，也一秉大公，决不宽贷!这个根挖到内阁当然是严嵩父子，挖到宫里只怕还牵涉到吕芳，一场政潮从浙江波及到北京已是暗流汹涌了!
半个月来，嘉靖帝潜伏在玉熙宫，严嵩潜伏在自己府里，徐阶潜伏在内阁值房，裕王府更是一直大门紧闭，杨金水被押进宫，浙江重审的供词如何，都像一块巨石沉重地压在裕王心头。李妃想着法儿，让冯保哄世子踢球使裕王开心，冯保无疑已成为裕王身边缺一不可的人物。
杨金水被送入宫中，遭众太监凌辱，黄锦看不过眼将众人拦下。陈洪仍不放过杨金水，对其施以毒刑。吕芳突然被嘉靖帝派去永陵，旨意是察看万年吉壤，并未明旨免去他的掌印太监之职，却又让陈洪暂署掌印，尽管宫里宫外许多猜测，毕竟不敢明传。对于陈洪的嚣张气焰，黄锦却不掩愤慨之情。
嘉靖帝询问押解杨金水进京的锦衣卫，了解了赵贞吉、谭纶、海瑞、王用汲审案的内情，并得知陈洪欲取代吕芳。审看完由锦衣卫带来的赵贞吉的奏疏，嘉靖帝亲审了杨金水。杨金水疯魔般交待出尚衣监、巾帽局、针工局、吕芳、郑泌昌、何茂才，还有严嵩父子，唯没有胡宗宪和嘉靖帝。问完杨金水，嘉靖帝命黄锦从后宫出宫，召吕芳进见。
大明王朝1566第28集剧情介绍嘉靖帝以“行到水穷处，坐看云起时”，暗示陈洪到诏狱查问芸娘。高翰文把自己那一腔化为流水的抱负所经历的挫跌，全算在眼前的芸娘身上。芸娘也知道高翰文心里一直都看不起自己，也痛恨高翰文与沈一石一样没有稽康的胸怀。第二天一早芸娘就要走了，临行前将沈一石留下的那把难得的古琴，又留给了高翰文。
吕芳被召回。嘉靖帝痛斥他私自跑去找严嵩找徐阶，还捧上一坛四十年的陈酿去劝酒。正应了明太祖高皇帝朱元璋“杯酒释兵权”的典故，必定让两方有所动作，吕芳这才知道自己做错了事。
嘉靖帝将海瑞重审的供状给吕芳看了，然后又命吕芳将供状重新封好，以示自己也没有看。告诉吕芳，现在除了郑泌昌、何茂才和尚衣监、针工局、巾帽局为首的奴婢，其他的人，一个不杀，一个不抓，并要吕芳将这个旨意尽快传知严嵩和徐阶，稳定人心。
中元之时，嘉靖帝与吕芳、徐阶、严嵩君臣四人头戴香冠，在宫殿中敬天修醮，当着严嵩、徐阶的面嘉靖帝将那封重新封好的海瑞的供状付之一炬。
