药物治疗的目的主要是抑制卵巢功能，造成假孕或假绝经状态等。
子宫内膜异位症的药物治疗
子宫内膜异位症的病因不清，目前尚无根治的药物。因为子宫内膜异位症是激素依赖性疾病，所以药物治疗的目的主要是抑制卵巢功能，造成假孕或假绝经状态，减少内异症病灶的活性以及减少粘连的形成，缓解疼痛，抑制术后残余病灶，预防复发，缩短复发的间期。促进生育。
可供选择的药物主要有四类，主要的副作用如下:
1、口服避孕药:连续或周期用药6个月，副作用较少，可有消化道症状或肝功能异常等。
2、孕激素:主要是突破性出血、乳房胀痛、体重增加、消化道症状以及肝功能异常等。
3、孕三酮:主要是雄激素样作用，如毛发增多、声音变粗、面部痤疮、体重增加、肝功异常。
4、GnRHa:年轻需要生育的患者首选此药治疗3~6个月，副作用主要是由于低雌激素血症引起潮热、阴道干燥、性欲下降、失眠及抑郁等，长期应用可引起骨质疏松。
